Кафедра вычислительной математики была образована в 1951 году. Её первыми сотрудниками стали члены кафедры математического анализа профессор Леонид Витальевич Канторович (впоследствии академик АН СССР, лауреат Нобелевской премии по экономике), доцент Марк Константинович Гавурин (позже профессор, заведующий кафедрой), ассистент Иван Петрович Мысовских (впоследствии профессор, заведующий кафедрой), профессор кафедры общей математики Владимир Иванович Крылов и аспирант Александр Николаевич Балуев.

Первым заведующим кафедрой стал В.И. Крылов (1951-1957). В 1956 г. В.И. Крылов был избран академиком АН БССР и вскоре переехал в Минск. С этого момента до 1960 г. (до переезда в Новосибирск) кафедрой заведовал Л.В. Канторович. С 1960 г. кафедрой заведовал М.К. Гавурин. В 1970 г. произошло разделение кафедры вычислительной математики на три: на её основе были образованы две новые кафедры - исследования операций и математического обеспечения ЭВМ. М.К. Гавурин возглавил кафедру исследования операций, кафедрой вычислительной математики стал заведовать И.П. Мысовских (1970-1997), а с 1997 года ею заведует профессор Виктор Михайлович Рябов.